Prossimi Passi - Trascrizione¶
Traduzione assistita da IA - scopri di più e suggerisci miglioramenti
Note importanti
Questa pagina mostra solo la trascrizione. Per le istruzioni complete passo dopo passo, torni al materiale del corso.
Benvenuto¶
Congratulazioni, ce l'ha fatta. Ha completato il primo corso di formazione Nextflow, chiamato Hello Nextflow.
Ben fatto. La ringraziamo per aver seguito il corso e apprezziamo molto il tempo e l'impegno che ha dedicato all'apprendimento di Nextflow, e speriamo sinceramente che Le sia utile per il Suo lavoro.
Prossimi Passi¶
Per i prossimi passi, tenga d'occhio il portale di formazione: training.nextflow.io. Pubblichiamo continuamente nuovo materiale del corso e lo aggiorniamo regolarmente. Potrebbe quindi trovare formazione più avanzata o formazione specifica per un campo di ricerca di Suo interesse.
In particolare, consulti la pagina Nextflow for Science. Questa contiene una serie di corsi brevi che sono autonomi e che estendono ciò che ha imparato in Hello Nextflow a casi d'uso specifici.
Ce n'è uno per la Genomica e anche uno per l'RNA-seq. Speriamo di portarne presto altri.
Side Quests¶
Ci sono molti argomenti di cui avremmo potuto parlare in Hello Nextflow, ma che sarebbero stati troppo dettagliati. Alcuni di questi argomenti li stiamo inserendo nei Side Quests, che sono corsi brevi su temi specifici.
Ci sono anche i corsi più ampi di formazione fondamentale e formazione avanzata, che potrebbero includere contenuti di Suo interesse.
nf-core¶
È stato menzionato una o due volte in questo corso, ma consulti sicuramente il progetto nf-core. Ci sono oltre cento pipeline per diversi tipi di dati, quindi è del tutto possibile che non debba costruire la propria pipeline.
Ci sono anche quasi millecinquecento moduli di processo dove, se utilizza gli strumenti di sviluppo nf-core, può creare una pipeline e importare quei moduli in pochi secondi.
Seqera Platform¶
Infine, una rapida presentazione di Seqera Platform. Questo è senza dubbio il modo migliore per eseguire Nextflow nella pratica, è una piattaforma basata sul cloud, ma Lei collega la propria infrastruttura di calcolo, che sia il proprio account cloud su AWS, Google Batch o Azure, o persino il proprio HPC. Il livello gratuito è disponibile per tutti, e se è un accademico, può candidarsi al nostro programma accademico per un accesso gratuito di livello pro.
Seqera Platform va oltre una semplice interfaccia grafica per avviare e monitorare i workflow. Ci sono anche strumenti aggiuntivi come Data Studios per eseguire sessioni interattive e strumenti fondamentali come Fusion, che offre un accesso ai dati più veloce ed economico sul cloud.
Supporto ed eventi¶
Ricordi, se dovesse incontrare qualsiasi difficoltà, vada su community.seqera.io. Il nostro forum è molto attivo, la comunità Nextflow è estremamente forte e ci sono quasi sempre persone pronte ad aiutare, sia per la formazione che per qualsiasi cosa riguardante l'uso quotidiano di Nextflow.
E naturalmente, un ottimo prossimo passo è partecipare a uno dei nostri eventi della comunità, che sia un hackathon nf-core o uno degli eventi Nextflow Summit. Sono molto divertenti e sarebbe davvero bello incontrarLa lì e parlare di come sta utilizzando Nextflow.
Ringraziamenti¶
Vorrei ringraziare enormemente tutti coloro che sono stati coinvolti nella scrittura di questo materiale di formazione. Io l'ho presentato, ma tutto il lavoro duro è stato fatto dal team di formazione di Seqera. In particolare Geraldine, che ha dedicato un'enorme quantità di lavoro alla riscrittura di questo materiale.
Anche Marcel, Ken, Adam, John, altri del team di sviluppo scientifico e altri membri della comunità.
Sondaggio di feedback¶
Ora che ha completato il corso, ci piacerebbe sapere cosa ne pensa. Su training.nextflow.io, troverà un sondaggio di feedback sotto la sezione Hello Nextflow.
Ci sono solo quattro domande ma è davvero importante per noi. Se non altro, ci dice approssimativamente quante persone stanno seguendo la formazione. Ci dice anche se Le è piaciuto e se ha suggerimenti, li inserisca pure alla fine. Leggiamo ogni singola risposta.
Se individua errori, tutto è open source su GitHub, quindi può creare un issue o fare una pull request o lasciarci un messaggio nel forum. Ci piacerebbe sapere cosa ne pensa e come potremmo migliorarlo. Grazie ancora. Speriamo di vederLa presto.